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Exercice d'identification

Utiliser les tableaux d'orientation pour identifier les bactéries suivantes
(les dessins sont de facture ancienne… car réalisés il y a des lustres !)

 

Il est nécessaire d'identifier dans un premier temps la famille… La macroscopie n'est pas indiquée (mais ne présente pas de particularités significatives).

 

Exercice 1

Exercice 2

Exercice 3

Exercice 4

Exercice 5

Colonies S de 3 mm, translucides, bacilles Gram - , oxydase-, mobile par ciliature présumée péritriche

Exercice 6

Bactéries isolées sur Drigalski, colonies S de 2 mm bleues, opaques, bacilles Gram - , oxydase-, mobile par ciliature indéterminée

Exercice 7

Colonies S de 3 mm, translucides, bacilles Gram - , oxydase-, mobile par ciliature présumée péritriche

Exercice 8

Colonies S de 2 mm, translucides, bacilles Gram - , oxydase-, immobile 

 
 
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Voici une galerie possible :

 Milieu  Test à réaliser
  Résultats lisibles
 Gélose ordinaire ou autre milieu équivalent

Examens microscopiques

Oxydase 

 Pureté, macroscopie, production de pigments, culture,

 Gram, Mobilité et son type
 VF (remplaçable par la lecture du culot de Kligler
    Type respiratoire
 Hugh et Leifson glucosé    Voie d'attaque du Glucose

 Kligler (glucose-lactose-H2S)

 recherche éventuelle de l'ONPG hydrolase
(bétagalactosidase)

 Fermentation du glucose et Gaz en glucose
 Utilisation du lactose
 Production H2S
 Mannitol-Mobilité-Nitrates  recherche des nitrites  Utilisation du mannitol
 Production de gaz (qui peut être du diazote si man -)
 Culture en profondeur par respiration nitrates
si la souche est aérobie stricte
 Urée Tryptophane
  TDA, Indole  Uréase
 Tryptophanase (Indole)
 Tryptophane désaminase (TDA)
 Citrate de Simmons
    Utilisation du Citrate comme seule source de Carbone
 Clark et Lubs
(bouillon riche glucosé)		  VP et
 pour les nostalgiques RM (si 48 h)		  Production de 3-hdroxybutanone et dérivés
 ADH, LDC, ODC
    ADH, LDC, ODC
 Film photographique…    Gélatinase

  (O129 (disque sur la GO))

  

 S/R au composé O129 si soupçon de Vibrio

La galerie traditionnelle peut être remplacée par un équivalent réalisé en microplaque.
Cette galerie traditionnelle sera évidemment remplacée avantageusement par une microgalerie commercialisée.

Ensemencement (extrait de Documentation technique)

La technique décrite ici repose sur une optimisation destinée à réduire au maximum le matériel utilisé et le temps ! On peut estimer, une fois les milieux préparés, un ensemencement réalisé en quelques minutes.

  • L'anse est utilisée pour préparer la suspension.
  • La pipette ouverte (qui permet la rapidité) pour le maximum de milieux.
  • La pipette fermée sert à réaliser les milieux piqués et l'isolement. Il ne faut pas craindre le passage d'un peu de milieu d'un milieu au suivant. En commençaut par Mannitol mobilité, on s'évite une éventuelle pollution par le glucose.

 

 

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DOCUMENTATION TECHNIQUE DE MICROBIOLOGIE

Avec Guy LEYRAL, nous avons publié, au CRDP d'Aquitaine, une documentation technique de Microbiologie.

L'idée était de fournir à chaque étudiant les documents utiles à la réalisation pratique des manipulations dans le cadre des différents BTS de biologie, et en particulier le BTS ABM. L'édition actuelle est obsolète (téléchargement possible en cliquant sur ce lien). Les importantes évolutions de l'informatique rendent nécessaire une nouvelle approche, celle du "livre" numérique.

Voici donc une première tentative de documentation sous forme informatique. Elle est expérimentale et destinée à tester les différentes possibilités.
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.">Vos critiques et observations seront les bienvenues ! Merci d'avance.

Pour commencer, choisir, dans le menu, le type de bactérie rencontrée au Gram, puis soit l'introduction, soit directement vers une catégorie particulière.
On pourra utiliser des liens dans le tableau ci-dessous. On comprendra que la structure actuelle est expérimentale. Des menus spécifiques sont prévus pour un accès direct au chapitre voulu. 

Vous pouvez compléter l'information sur les taxons dans le menu "Microbiologie" puis "Systématique bactérienne 2020"… ou dans "Mycologie".

Légende des tableaux : nombre = % de positivité / + = plus de 80% de caractère + , - = moins de 80% de caractère -, V = variable (caractère + ou - selon le taxon), éventuellement : absence de données

INTRODUCTION  
Vue d'ensemble des bactéries

Première partie:
GRAM + cultivant en aérobiose

orientation Gram + cultivant en aérobiose
Deuxième partie :

GRAM - cultivant en aérobiose
1. Principaux groupes
  • globalement 
2. Enterobactéries (Enterobacteriaceae) (Bacilles gram - peu exigeants, oxydase négative (Enterobacteriaceae, rarement Vibrionaceae, Aeromonadaceae))
3. Bactéries Gram - Non Enterobactéries (Bacilles/coques gram - peu exigeants oxydase + (Pseudomonas et apparentés, Vibrionaceae, Aeromonadaceae, Acinetobacter))
4. Bacilles gram - exigeants, aéroanaérobies : Pasteurellaceae
5. Coques et coccobacilles Gram - aérobies strictes de culture difficile
6. Bactéries Gram - microaérophiles
7. Comment choisir une galerie pour une bactérie gram négative ? EN TRAVAUX
Troisième partie :

ANAÉROBIES STRICTES
CHAMPIGNONS
BIBLIOGRAPHIE  EN TRAVAUX
COMPLÉMENTS  
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galerie traditionnelle non entérobactérie (NE) et son ensemencement

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On peut clairement dire qu'une galerie traditionnelle n'est pas réellement une solution pour identifier ces bactéries. On peut touefois faire un peu comme pour les Entérobactéries... Voici une galerie possible :

Milieu Test à réaliser
 Résultats lisibles
Gélose ordinaire ou autre milieu équivalent

Examens microscopiques

Oxydase

Pureté, macroscopie, production de pigments, culture,

Gram, Mobilité et son type
VF (remplaçable par la lecture du culot de Kligler)
   Type respiratoire
Hugh et Leifson glucosé   Voie d'attaque du Glucose

Kligler (glucose-lactose-H2S)

recherche éventuelle de l'ONPG hydrolase
(bétagalactosidase)

Fermentation ou non du glucose et Gaz en glucose
Utilisation du lactose
Production H2S
Mannitol-Mobilité-Nitrates recherche des nitrites Utilisation du mannitol
Production de gaz (qui peut être du diazote si man -)
Culture en profondeur par respiration nitrates
si la souche est aérobie stricte
Urée Tryptophane
 TDA, Indole Uréase
Tryptophanase (Indole)
Tryptophane désaminase (TDA)
Citrate de Simmons
   Utilisation du Citrate comme seule source de Carbone
Clark et Lubs
(bouillon riche glucosé)		 VP et
pour les nostalgiques RM (si 48 h)		 Production de 3-hydroxybutanone et dérivés
ADH, LDC, ODC
   ADH, LDC, ODC (attention : pour les aérobies strictes il n'y aura pas de culture... sauf pour ADH parfois. La lecture n'est donc pas possible le plus souvent sauf pour une ADH+. Mieux vaut ensemencer une API20E !
Film photographique…   Gélatinase

(O129 (disque sur la GO))

  

S/R au composé O129 si soupçon de Vibrio/aeromonas

La galerie traditionnelle peut être remplacée par un équivalent réalisé en microplaque.
Cette galerie traditionnelle sera évidemment remplacée avantageusement par une microgalerie commercialisée.

Ensemencement (extrait de Documentation technique)

La technique décrite ici repose sur une optimisation destinée à réduire au maximum le matériel utilisé et le temps ! On peut estimer, une fois les milieux préparés, un ensemencement réalisé en quelques minutes.

  • L'anse est utilisée pour préparer la suspension.
  • La pipette ouverte (qui permet la rapidité) pour le maximum de milieux.
  • La pipette fermée sert à réaliser les milieux piqués et l'isolement. Il ne faut pas craindre le passage d'un peu de milieu d'un milieu au suivant. En commençaut par Mannitol mobilité, on s'évite une éventuelle pollution par le glucose.

 

 

 

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MaQ

Cette page vous donne accès à un système php expérimental d'identification.

Accès aux pages du MAQ écrites par les étudiants.Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. ! Merci d'avance. 

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Détails techniques

Langage utilisé : php

 

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