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Antibiotiques et antibiogramme


L'antibiogramme permet de déterminer les catégories cliniques pour un antibiotique vis-à-vis du microorganisme testé.

L'opération consiste, dans la méthode des disques, à mesurer le diamètre et comparer aux diamètres critiques. Un calcul de CMI approximatif peut être réalisé.

La feuille proposée réalise l'automatisation des opérations : il suffira de rentrer les diamètres pour que la feuille conclue quand cela est possible. On trouvera, dans les différents onglets de la deuxième feuille, des solutions pour des études statistiques de résultats multiples.

Télécharger la feuille simple

Télécharger la feuille avec statistiques

 


 

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Classement

généralités

Si l'on veut réaliser un classement à partir d'une série de valeurs, par exemple de notes, une formule astucieuse permet de la faire élégamment. Elle a été publiée dans Science et Vie Macintosh en avril 2000.


utilisation d'Excel

  • La matrice B4:B12 est nommée note.

N'HÉSITEZ PAS À ME FAIRE PART DE VOS REMARQUES. IL N'EST PAS DU TOUT IMPOSSIBLE QUE DES ERREURS SE SOIENT GLISSÉES DANS MON PROPOS !

 

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Contrôles des pipettes à piston

feuille de calcul revue le 12 décembre 2011

Le contrôle des pipettes nécessite la réalisation d'un certain nombre d'essais et donc une analyse statistique.
Le tableur s'impose donc pour réaliser cette analyse.


Méthode de contrôle

Le contrôle repose sur la pesée, la balance étant l'instrument le plus "précis", et le mieux contrôlé, utilisable.
La pipette mesurant un volume de liquide, c'est l'eau qui est pesée. Pour connaître la relation entre la masse de l'eau et son volume, on se reportera au calcul de Z, facteur qui permet de déterminer le volume d'une masse d'eau en fonction de la température et de la pression.

Le volume v est donc le produit de m par Z : v= m.Z

On réalise donc une série de pesées pour un volume affiché donné pour déterminer :

    * la moyenne, permettant d'estimer la justesse (et non l'exactitude) par comparaison à la valeur affichée.
    * l'écart-type, mesure de la dispersion et donc de la répétabilité (la mesure étant réalisée par le même opérateur).

Le but est d'avoir la pipette la plus juste et la plus répétable possible. Bien évidemment, elle ne sera pas parfaite et le fabricant indiquera des tolérances sous la forme d'une valeur à ne pas dépasser pour les deux paramètres.


La feuille de calcul

La feuille proposée développe deux méthodes différentes de pesée :

  • la première consiste à peser, noter la masse, puis tarer, puis recommencer jusqu'à 10 essais.
  • la deuxième consiste à peser, noter la masse, puis recommencer, en notant donc la masse cumulée, jusqu'à 10 essais. En évitant le tarage, la durée des mesures sera réduite facilitant le travail.

Z est introduit soit par une formule tenant compte de la température et de la pression qui doivent être renseignées. Attention, la pression est en kPa et non hPa (Pression normale dans l'atmosphère par beau temps à 0 m d'altitude vers 101,3 kPa = 1013 hPa (ou mBar))

Le volume cible affiché par la pipette est noté.
Les tolérances du constructeur sont notées pour le volume cible choisi.

La feuille calcule alors, une fois les données de mesure entrées :

  • la moyenne,
  • l'erreur de justesse, différence entre la valeur cible et la moyenne,
  • l'écart type qui est l'erreur de répétabilité (fidélité)


Elle évalue ensuite, pour un volume cible donné :

  •  la justesse (en comparant la valeur absolue de l'erreur de justesse et la tolérance de justesse),
  •  la fidélité (en comparant l'écart type de la mesure et la tolérance de répétabilité),
  •  puis conclut pour le volume cible considéré, si la pipette est conforme ou non.


La même opération doit être répétée pour d'autres volumes cibles. Deux sont prévus dans la feuille avec la maximum de la pipette et son minimum. Il faudrait ajouter le volume central, soit pour les trois volumes d'une P1000 : 1000 µL, 100 µL et 500 µL.
Une conclusion finale permet de savoir si la pipette est ou non utilisable. Si l'on souhaite ajouter un essai, une modification simple de la feuille sera nécessaire (il suffit de recopier sur la droite la table de mesures d'un volume).

La feuille est protégée mais sans mot de passe pour éviter la destruction des formules de calcul !
Pour Z voir article correspondant.


télécharger la feuille (elle inclut les feuilles concernant Z)


 

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Comparaison théorique de la croissance de deux souches microbiennes

Supposons deux souches microbiennes dans un même milieu, souches poursuivant une croissance de type exponentiel.

Elles sont caractérisées par :

  • leur durée de génération (ou leur taux de croissance)
  • leur concentration initiale.

Le but de la feuille est de les comparer : les valeurs des deux paramètres sont fixées et on peut alors voir l'évolution des deux populations et en particulier visualiser le moment où les populations s'égalisent.

À vous de jouer en téléchargeant la feuille !

 

 


 

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Croissance microbienne


 

Les courbes de croissance sont évidemment faciles à tracer à l'aide du grapheur.

Les calculs seront évidemment réalisés par le tableur… Mais une petite difficulté rend délicate l'automatisation des opérations : le calcul des durées de génération, du taux de croissance et de la vitesse spécifique de croissance se font habituellement dans la phase exponentielle. Il n'est pas facile d'automatiser la recherche des bornes de la phase exponentielle qui doit donc être faite à la "main" en regardant la courbe tracée.

La feuille proposée, au prix de la modification manuelle des formules donnant la pente et l'ordonnée à l'origine, peut :

  • tracer la courbe obtenue,
  • déterminer les paramètres, y compris la durée de latence, après introduction des formules,
  • tracer la droite de la phase exponentielle théorique,
  • tracer d'autres droites avec des paramètres de pente différents (même durée de latence).

Les différentes explications nécessaires se trouvent dans le fichier tableur à télécharger :  télécharger


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